Valsts prezidenta kanceleja ir patstāvīga institūcija, kas nodrošina Valsts prezidenta darbību. Iestāde atrodas tiešā Valsts prezidenta pakļautībā, un to vada Valsts prezidenta iecelts vadītājs. Kancelejas sastāvā ir vadītājs, divi vietnieki, viens no viņiem arī Valsts prezidenta padomnieku biroja vadītājs, Valsts prezidenta padomnieki, Ordeņu kapitula sekretārs, Valsts heraldikas komisijas priekšsēdētāja vietnieks administratīvajos jautājumos, iestādes juridiskie padomnieki, personāla vadītājs, iestādes konsultanti un šādas struktūrvienības:
- Apžēlošanas dienests;
- Finanšu uzskaites nodaļa;
- Informācijas tehnoloģiju nodaļa;
- Lietvedības nodaļa;
- Mediju centrs;
- Saimnieciskā nodrošinājuma nodaļa;
- Sekretariāts;
- Valsts prezidenta protokols.